language

开放平台

cellenONE具有很高的通用性,因为它适用于各种消耗品格式(96、384、1536wp和像cellenCHIP™这样的纳米孔底物)的制备方案。

与其他单细胞技术不同,cellenONE具有出色的细胞回收率(高达95%),这也使其成为稀有细胞分离的理想工具。


Homebrew 3’ scRNA-Seq in cellenCHIP

在cellenCHIP中使用了一系列可自购的试剂开发了3'scRNA-Seq方案。


以下步骤描述了使用cellenCHIP和烯酮

比较了3种不同的逆转录酶(RTase_1至_3)。

为了验证这些协议,依次将两种细胞类型(HEK和NIH_3T3)作为检查板与几个控件进行了隔离。

用100nL的缓冲液混合物(裂解液和RT试剂)填充OligodT带条形码的孔。

单细胞分离后,将cellenCHIP密封并放入热循环仪中进行逆转录和模板转换反应。

cellenFUNNELS用于将反应混合物合并到微量离心管中,其余步骤(cDNA扩增,标记和文库扩增)按文献所述进行。

经过测序和生物信息学分析,所有3种酶均显示出可重复的结果。

RTase_1表现最佳,每个单细胞最多可检测7000个基因,而每个单细胞中值可检测5000个基因。

分析所有文库(Bioanalyzer),并始终显示约500bp的片段。

优势

与多种市售酶和试剂兼容。

该方法适用于从几个(<100)到1000格的各种大小的样本。

在cellenCHIP中100nL裂解和RT联用的简化方案。

低PCR循环次数(<18),可最大程度地减少数据偏差 并限制UMI复制。

在生物复制品中观察到高重复性。

高质量,背景极小或为零。

高性能,每个单细胞最多可检测7000个基因(检测到中位数5000个基因),而所需的读取量却很少(每个单细胞中值100,000个映射读取值)。

 

 


稀有细胞分离,用于单细胞RNA测序

与旧金山威尔研究所神经病学系合作,进行了一项研究,旨在分离多发性硬化症患者脑脊液(CSF)样品中的单个免疫细胞,以用于后续的单细胞RNA测序。

与此类样品相关的主要挑战是,这些样品中存在的细胞数量非常低,每20mL患者的CSF仅可变化20至500个细胞。

平均而言,回收率达到95%,这意味着每个样品中存在的大多数细胞都被成功分离为单细胞(用cellenONE X1成功分离的单细胞数超过了每个样品的平均细胞数)。

 

显微镜计数细胞数与cellenONE分离细胞数的平均值

优势

微量样品(仅1μL)

回收率高达95%

无死体积

合作伙伴