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cellenONE提供了高精度的单细胞分离，但它也提供了许多附加功能来使文库制备小型化
cellenONE允许从100pL到几微升的任何试剂的高精度分配
cellenONE使用高分辨率的机器人技术，可将试剂分配在任何亚孔96、384、1536、3456微孔板以及纳米孔底物中（例如cellenCHIP™）
cellenONE通过温度，湿度和自动露点控制提供高级环境控制，这是处理亚微升容量时的基本功能
与基于微滴的方法无法添加多种试剂不同，cellenONE可以进行多种干预，从而可以实施大多数单细胞组学方法
优势
试剂体积减少50倍至100倍
(vs. 96/384wp)
大幅降低成本
单细胞组学方法的实现
较低的背景和更好的敏感性
通过将高精度的单细胞分离与纳升分配功能相结合，现在可以使用cellenONE使无数的分子生物学和蛋白质组学方案最小化。
如果您已经建立或新颖的协议希望将其小型化，并想了解如何使用cellenONE实施这些协议，请随时通过[email protected]与我们联系。
Cellenion提供了一系列条形码服务，以帮助您将协议实施到cellenCHIP或其他纳米孔底物中。基于溶液的寡聚条形码（例如oligodT条形码）或带条形码的珠子都可以预装在您选择的基材中。
请通过[email protected]与我们联系以了解更多信息。
通过结合cellenONE的单细胞分离和纳升分配功能，Sam Aparicio（温哥华，UBC）和Sohrab Shah（纽约，MSKCC）团队开发了一种可扩展的单细胞全基因组测序方法，称为Direct Library Preparation Plus（DLP+）。
最近，该方法的详细信息以开放获取的形式发表在Cell杂志上。
生成的结果已编译到基于Web的交互式平台（www.cellmine.org）中。
这种经济实惠的低偏差方法允许对各种样品进行深度分析。它可以确定拷贝数变异（CNV），单核苷酸多态性（SNP），聚类分析和系统重建。
现在，该方法已在不列颠哥伦比亚癌症研究中心作为例行程序实施，并被全球领先的研究中心采用。
方法开发者
Clonal Decomposition and DNA Replication States Defined by Scaled Single-Cell Genome Sequencing
Laks et al., 2019, Cell 179, 1207–1221
这些方法现已在这些世界领先的研究中心实施
为了成功地使文库制备最小化，必须使用专为亚微升体积工作设计的底物。
Cellenion开发了cellenCHIP™，这是一种创新的纳米孔芯片，在显微镜载玻片上占地384个孔。
总共可以在cellenONE卡座上放置8个cellenCHIP（3072个单电池）。
使用cellenONE和cellenCHIP来使基于96wp的商业转录组试剂盒（QIAseq UPX 3'，Qiagen）小型化。
使用的所有浓度均保持与制造商的建议相同。
通过将反应体积最小化至每孔100nL，可以仅使用一个96wp试剂盒为1536个单细胞（4x cellenCHIP）制备文库。
结果显示在cellenCHIP和96wp中具有同等的性能（UMI和检测到的基因数量/单细胞）！
| QIAseq UPX 3' | cellenCHIP |
|---|---|
| 96 unique oligo dT | 96 unique oligo dT |
| 5 μl/well | 100 nL/well |
| 96 single cells | 1536 single cells |
| €27/cell | €2.5/cell |
以下步骤描述了使用QIAGEN套件，cellenCHIP™和cellenONE®的工作流程
优势
数据与其他scRNA-seq技术定量匹配
将商用96wp套件无缝实现到cellenCHIP中
裂解的最小化和反向带条形码的cellenCHIP中的转录
与96wp格式相比，性能更高
每个单元的成本从27欧元大幅降低到2.5欧元以下
在cellenCHIP中使用了一系列可商购的试剂开发了3'scRNASeq方案。
以下步骤描述了使用cellenCHIP和cellenONE®的工作流程
比较了3种不同的逆转录酶（RTase_1至_3）。
为了验证这些协议，依次将两种细胞类型（HEK和NIH_3T3）作为棋盘图案与几个控件进行了隔离。
用100nL的缓冲液混合物（裂解液和RT试剂）填充OligodT带条形码的孔。
单细胞分离后，将cellenCHIP密封并放入热循环仪中进行逆转录和模板转换反应cellenFUNNELS用于将反应混合物合并到微量离心管中，其余步骤（cDNA扩增，标记和文库扩增）按文献所述进行。
经过测序和生物信息学分析，所有3种酶均显示出可重复的结果。
RTase_1表现最佳，每个单细胞最多可检测7000个基因，而每个单细胞中值可检测5000个基因。
分析了所有文库（Bioanalyzer），并始终显示约500bp的片段。
优势
与多种市售酶和试剂兼容。
该方法适用于从几个（<100）到1000格的各种样本大小的样本。
在cellenCHIP™中100nL裂解和RT联用的简化方案。
低PCR循环次数（<18），可最大程度地减少数据偏差并限制UMI复制。
在生物复制品中观察到高重现性。
高质量，背景极小或为零。
高性能，每个单细胞最多可检测到7000个基因（检测到中位数5000个基因），而所需的读取量却很少（每个单细胞中位数为100,000个映射读取）。
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